All Coding Repeats of Sinorhizobium fredii USDA 257 plasmid pUSDA257
Total Repeats: 157
S.No. | Genome ID | Motif | Iterations | Length | Start | End | A% | T% | G% | C% | Protein ID |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
1 | NC_018184 | CTG | 2 | 6 | 76 | 81 | 0 % | 33.33 % | 33.33 % | 33.33 % | 398356041 |
2 | NC_018184 | GCC | 2 | 6 | 172 | 177 | 0 % | 0 % | 33.33 % | 66.67 % | 398356041 |
3 | NC_018184 | GGA | 2 | 6 | 185 | 190 | 33.33 % | 0 % | 66.67 % | 0 % | 398356041 |
4 | NC_018184 | ACG | 2 | 6 | 205 | 210 | 33.33 % | 0 % | 33.33 % | 33.33 % | 398356041 |
5 | NC_018184 | CTT | 2 | 6 | 267 | 272 | 0 % | 66.67 % | 0 % | 33.33 % | 398356041 |
6 | NC_018184 | GC | 3 | 6 | 288 | 293 | 0 % | 0 % | 50 % | 50 % | 398356041 |
7 | NC_018184 | TC | 3 | 6 | 341 | 346 | 0 % | 50 % | 0 % | 50 % | 398356041 |
8 | NC_018184 | AGGT | 2 | 8 | 352 | 359 | 25 % | 25 % | 50 % | 0 % | 398356041 |
9 | NC_018184 | AGGAA | 2 | 10 | 365 | 374 | 60 % | 0 % | 40 % | 0 % | 398356041 |
10 | NC_018184 | ATC | 2 | 6 | 384 | 389 | 33.33 % | 33.33 % | 0 % | 33.33 % | 398356041 |
11 | NC_018184 | TAAAG | 2 | 10 | 491 | 500 | 60 % | 20 % | 20 % | 0 % | 398356041 |
12 | NC_018184 | GCA | 2 | 6 | 582 | 587 | 33.33 % | 0 % | 33.33 % | 33.33 % | 398356041 |
13 | NC_018184 | GCC | 2 | 6 | 603 | 608 | 0 % | 0 % | 33.33 % | 66.67 % | 398356041 |
14 | NC_018184 | GCC | 2 | 6 | 683 | 688 | 0 % | 0 % | 33.33 % | 66.67 % | 398356041 |
15 | NC_018184 | TCGA | 2 | 8 | 767 | 774 | 25 % | 25 % | 25 % | 25 % | 398356041 |
16 | NC_018184 | CTG | 2 | 6 | 786 | 791 | 0 % | 33.33 % | 33.33 % | 33.33 % | 398356041 |
17 | NC_018184 | GGCA | 2 | 8 | 796 | 803 | 25 % | 0 % | 50 % | 25 % | 398356041 |
18 | NC_018184 | GATG | 2 | 8 | 926 | 933 | 25 % | 25 % | 50 % | 0 % | 398356041 |
19 | NC_018184 | CTT | 2 | 6 | 942 | 947 | 0 % | 66.67 % | 0 % | 33.33 % | 398356041 |
20 | NC_018184 | GTT | 2 | 6 | 956 | 961 | 0 % | 66.67 % | 33.33 % | 0 % | 398356041 |
21 | NC_018184 | GCT | 2 | 6 | 1020 | 1025 | 0 % | 33.33 % | 33.33 % | 33.33 % | 398356041 |
22 | NC_018184 | CCG | 2 | 6 | 1034 | 1039 | 0 % | 0 % | 33.33 % | 66.67 % | 398356041 |
23 | NC_018184 | CGA | 2 | 6 | 1150 | 1155 | 33.33 % | 0 % | 33.33 % | 33.33 % | 398356041 |
24 | NC_018184 | CGATC | 2 | 10 | 1157 | 1166 | 20 % | 20 % | 20 % | 40 % | 398356041 |
25 | NC_018184 | GAG | 2 | 6 | 1169 | 1174 | 33.33 % | 0 % | 66.67 % | 0 % | 398356041 |
26 | NC_018184 | CTT | 2 | 6 | 1200 | 1205 | 0 % | 66.67 % | 0 % | 33.33 % | 398356041 |
27 | NC_018184 | TGC | 2 | 6 | 1259 | 1264 | 0 % | 33.33 % | 33.33 % | 33.33 % | 398356041 |
28 | NC_018184 | AGG | 2 | 6 | 1315 | 1320 | 33.33 % | 0 % | 66.67 % | 0 % | 398356041 |
29 | NC_018184 | AGC | 2 | 6 | 1366 | 1371 | 33.33 % | 0 % | 33.33 % | 33.33 % | 398356041 |
30 | NC_018184 | TCG | 2 | 6 | 1408 | 1413 | 0 % | 33.33 % | 33.33 % | 33.33 % | 398356041 |
31 | NC_018184 | GAT | 2 | 6 | 1415 | 1420 | 33.33 % | 33.33 % | 33.33 % | 0 % | 398356041 |
32 | NC_018184 | ATG | 2 | 6 | 1549 | 1554 | 33.33 % | 33.33 % | 33.33 % | 0 % | 398356041 |
33 | NC_018184 | GC | 3 | 6 | 1606 | 1611 | 0 % | 0 % | 50 % | 50 % | 398356041 |
34 | NC_018184 | CGT | 2 | 6 | 1612 | 1617 | 0 % | 33.33 % | 33.33 % | 33.33 % | 398356041 |
35 | NC_018184 | CGT | 2 | 6 | 1649 | 1654 | 0 % | 33.33 % | 33.33 % | 33.33 % | 398356041 |
36 | NC_018184 | CCG | 2 | 6 | 1657 | 1662 | 0 % | 0 % | 33.33 % | 66.67 % | 398356041 |
37 | NC_018184 | TC | 3 | 6 | 1668 | 1673 | 0 % | 50 % | 0 % | 50 % | 398356041 |
38 | NC_018184 | CCG | 2 | 6 | 1703 | 1708 | 0 % | 0 % | 33.33 % | 66.67 % | 398356041 |
39 | NC_018184 | CG | 4 | 8 | 1814 | 1821 | 0 % | 0 % | 50 % | 50 % | 398356041 |
40 | NC_018184 | ATG | 2 | 6 | 1845 | 1850 | 33.33 % | 33.33 % | 33.33 % | 0 % | 398356041 |
41 | NC_018184 | CGA | 2 | 6 | 1852 | 1857 | 33.33 % | 0 % | 33.33 % | 33.33 % | 398356041 |
42 | NC_018184 | GCT | 2 | 6 | 1910 | 1915 | 0 % | 33.33 % | 33.33 % | 33.33 % | 398356041 |
43 | NC_018184 | GCA | 2 | 6 | 1916 | 1921 | 33.33 % | 0 % | 33.33 % | 33.33 % | 398356041 |
44 | NC_018184 | CGA | 2 | 6 | 2032 | 2037 | 33.33 % | 0 % | 33.33 % | 33.33 % | 398356041 |
45 | NC_018184 | TCCG | 2 | 8 | 2041 | 2048 | 0 % | 25 % | 25 % | 50 % | 398356041 |
46 | NC_018184 | GC | 3 | 6 | 2124 | 2129 | 0 % | 0 % | 50 % | 50 % | 398356041 |
47 | NC_018184 | GATC | 2 | 8 | 2150 | 2157 | 25 % | 25 % | 25 % | 25 % | 398356041 |
48 | NC_018184 | GAG | 2 | 6 | 2223 | 2228 | 33.33 % | 0 % | 66.67 % | 0 % | 398356041 |
49 | NC_018184 | GGGATC | 2 | 12 | 2239 | 2250 | 16.67 % | 16.67 % | 50 % | 16.67 % | 398356041 |
50 | NC_018184 | GAA | 2 | 6 | 2298 | 2303 | 66.67 % | 0 % | 33.33 % | 0 % | 398356041 |
51 | NC_018184 | GCA | 2 | 6 | 2350 | 2355 | 33.33 % | 0 % | 33.33 % | 33.33 % | 398356041 |
52 | NC_018184 | GC | 3 | 6 | 2366 | 2371 | 0 % | 0 % | 50 % | 50 % | 398356041 |
53 | NC_018184 | ATGC | 2 | 8 | 2476 | 2483 | 25 % | 25 % | 25 % | 25 % | 398356041 |
54 | NC_018184 | CAG | 2 | 6 | 2596 | 2601 | 33.33 % | 0 % | 33.33 % | 33.33 % | 398356041 |
55 | NC_018184 | TACC | 2 | 8 | 2690 | 2697 | 25 % | 25 % | 0 % | 50 % | 398356041 |
56 | NC_018184 | CGA | 2 | 6 | 2887 | 2892 | 33.33 % | 0 % | 33.33 % | 33.33 % | 398356041 |
57 | NC_018184 | CAC | 2 | 6 | 2998 | 3003 | 33.33 % | 0 % | 0 % | 66.67 % | 398356041 |
58 | NC_018184 | TCG | 2 | 6 | 3041 | 3046 | 0 % | 33.33 % | 33.33 % | 33.33 % | 398356041 |
59 | NC_018184 | GC | 3 | 6 | 3320 | 3325 | 0 % | 0 % | 50 % | 50 % | 398356041 |
60 | NC_018184 | GAG | 2 | 6 | 3327 | 3332 | 33.33 % | 0 % | 66.67 % | 0 % | 398356041 |
61 | NC_018184 | TCATC | 2 | 10 | 3368 | 3377 | 20 % | 40 % | 0 % | 40 % | 398356041 |
62 | NC_018184 | CCA | 2 | 6 | 3399 | 3404 | 33.33 % | 0 % | 0 % | 66.67 % | 398356041 |
63 | NC_018184 | GAC | 2 | 6 | 3447 | 3452 | 33.33 % | 0 % | 33.33 % | 33.33 % | 398356041 |
64 | NC_018184 | CTA | 2 | 6 | 3473 | 3478 | 33.33 % | 33.33 % | 0 % | 33.33 % | 398356041 |
65 | NC_018184 | GGC | 2 | 6 | 3491 | 3496 | 0 % | 0 % | 66.67 % | 33.33 % | 398356041 |
66 | NC_018184 | CGA | 2 | 6 | 3762 | 3767 | 33.33 % | 0 % | 33.33 % | 33.33 % | 398356042 |
67 | NC_018184 | CAGCC | 2 | 10 | 3845 | 3854 | 20 % | 0 % | 20 % | 60 % | 398356042 |
68 | NC_018184 | CCG | 2 | 6 | 3888 | 3893 | 0 % | 0 % | 33.33 % | 66.67 % | 398356042 |
69 | NC_018184 | CGCGG | 2 | 10 | 3899 | 3908 | 0 % | 0 % | 60 % | 40 % | 398356042 |
70 | NC_018184 | CAC | 2 | 6 | 3935 | 3940 | 33.33 % | 0 % | 0 % | 66.67 % | 398356042 |
71 | NC_018184 | CG | 3 | 6 | 4006 | 4011 | 0 % | 0 % | 50 % | 50 % | 398356042 |
72 | NC_018184 | CGA | 2 | 6 | 4048 | 4053 | 33.33 % | 0 % | 33.33 % | 33.33 % | 398356042 |
73 | NC_018184 | CCGT | 2 | 8 | 4162 | 4169 | 0 % | 25 % | 25 % | 50 % | 398356042 |
74 | NC_018184 | CG | 3 | 6 | 4180 | 4185 | 0 % | 0 % | 50 % | 50 % | 398356042 |
75 | NC_018184 | CGA | 2 | 6 | 4503 | 4508 | 33.33 % | 0 % | 33.33 % | 33.33 % | 398356043 |
76 | NC_018184 | AGA | 2 | 6 | 4553 | 4558 | 66.67 % | 0 % | 33.33 % | 0 % | 398356043 |
77 | NC_018184 | GCT | 2 | 6 | 4605 | 4610 | 0 % | 33.33 % | 33.33 % | 33.33 % | 398356043 |
78 | NC_018184 | ATG | 2 | 6 | 4767 | 4772 | 33.33 % | 33.33 % | 33.33 % | 0 % | 398356044 |
79 | NC_018184 | TTG | 2 | 6 | 4816 | 4821 | 0 % | 66.67 % | 33.33 % | 0 % | 398356044 |
80 | NC_018184 | GAC | 2 | 6 | 4884 | 4889 | 33.33 % | 0 % | 33.33 % | 33.33 % | 398356044 |
81 | NC_018184 | AAT | 2 | 6 | 4899 | 4904 | 66.67 % | 33.33 % | 0 % | 0 % | 398356044 |
82 | NC_018184 | GATA | 2 | 8 | 4977 | 4984 | 50 % | 25 % | 25 % | 0 % | 398356044 |
83 | NC_018184 | CCA | 2 | 6 | 5062 | 5067 | 33.33 % | 0 % | 0 % | 66.67 % | 398356044 |
84 | NC_018184 | TCATGG | 2 | 12 | 5135 | 5146 | 16.67 % | 33.33 % | 33.33 % | 16.67 % | 398356044 |
85 | NC_018184 | TTGGC | 2 | 10 | 5275 | 5284 | 0 % | 40 % | 40 % | 20 % | 398356044 |
86 | NC_018184 | GTC | 2 | 6 | 5418 | 5423 | 0 % | 33.33 % | 33.33 % | 33.33 % | 398356044 |
87 | NC_018184 | GGT | 2 | 6 | 5434 | 5439 | 0 % | 33.33 % | 66.67 % | 0 % | 398356044 |
88 | NC_018184 | AAT | 2 | 6 | 5448 | 5453 | 66.67 % | 33.33 % | 0 % | 0 % | 398356044 |
89 | NC_018184 | GGC | 2 | 6 | 5610 | 5615 | 0 % | 0 % | 66.67 % | 33.33 % | 398356044 |
90 | NC_018184 | ATTT | 2 | 8 | 5653 | 5660 | 25 % | 75 % | 0 % | 0 % | 398356044 |
91 | NC_018184 | CTG | 2 | 6 | 5787 | 5792 | 0 % | 33.33 % | 33.33 % | 33.33 % | 398356044 |
92 | NC_018184 | TCG | 2 | 6 | 5852 | 5857 | 0 % | 33.33 % | 33.33 % | 33.33 % | 398356044 |
93 | NC_018184 | GGCA | 2 | 8 | 5865 | 5872 | 25 % | 0 % | 50 % | 25 % | 398356044 |
94 | NC_018184 | GTG | 2 | 6 | 5886 | 5891 | 0 % | 33.33 % | 66.67 % | 0 % | 398356044 |
95 | NC_018184 | CATGC | 2 | 10 | 5904 | 5913 | 20 % | 20 % | 20 % | 40 % | 398356044 |
96 | NC_018184 | CGT | 2 | 6 | 5936 | 5941 | 0 % | 33.33 % | 33.33 % | 33.33 % | 398356044 |
97 | NC_018184 | GTCA | 2 | 8 | 6099 | 6106 | 25 % | 25 % | 25 % | 25 % | 398356045 |
98 | NC_018184 | CT | 3 | 6 | 6239 | 6244 | 0 % | 50 % | 0 % | 50 % | 398356045 |
99 | NC_018184 | ATT | 2 | 6 | 6296 | 6301 | 33.33 % | 66.67 % | 0 % | 0 % | 398356045 |
100 | NC_018184 | GTG | 2 | 6 | 6316 | 6321 | 0 % | 33.33 % | 66.67 % | 0 % | 398356045 |
101 | NC_018184 | CG | 3 | 6 | 6415 | 6420 | 0 % | 0 % | 50 % | 50 % | 398356045 |
102 | NC_018184 | AGC | 2 | 6 | 6551 | 6556 | 33.33 % | 0 % | 33.33 % | 33.33 % | 398356045 |
103 | NC_018184 | TGA | 2 | 6 | 6568 | 6573 | 33.33 % | 33.33 % | 33.33 % | 0 % | 398356045 |
104 | NC_018184 | GGT | 2 | 6 | 6723 | 6728 | 0 % | 33.33 % | 66.67 % | 0 % | 398356045 |
105 | NC_018184 | CTT | 2 | 6 | 6729 | 6734 | 0 % | 66.67 % | 0 % | 33.33 % | 398356045 |
106 | NC_018184 | CGCT | 2 | 8 | 6784 | 6791 | 0 % | 25 % | 25 % | 50 % | 398356045 |
107 | NC_018184 | GAT | 2 | 6 | 6828 | 6833 | 33.33 % | 33.33 % | 33.33 % | 0 % | 398356045 |
108 | NC_018184 | ATC | 2 | 6 | 6858 | 6863 | 33.33 % | 33.33 % | 0 % | 33.33 % | 398356045 |
109 | NC_018184 | TGG | 2 | 6 | 6961 | 6966 | 0 % | 33.33 % | 66.67 % | 0 % | 398356046 |
110 | NC_018184 | GCG | 2 | 6 | 6976 | 6981 | 0 % | 0 % | 66.67 % | 33.33 % | 398356046 |
111 | NC_018184 | TCG | 2 | 6 | 7071 | 7076 | 0 % | 33.33 % | 33.33 % | 33.33 % | 398356046 |
112 | NC_018184 | GGC | 2 | 6 | 7096 | 7101 | 0 % | 0 % | 66.67 % | 33.33 % | 398356046 |
113 | NC_018184 | CCA | 2 | 6 | 7180 | 7185 | 33.33 % | 0 % | 0 % | 66.67 % | 398356046 |
114 | NC_018184 | GCG | 2 | 6 | 7275 | 7280 | 0 % | 0 % | 66.67 % | 33.33 % | 398356046 |
115 | NC_018184 | GGT | 2 | 6 | 7402 | 7407 | 0 % | 33.33 % | 66.67 % | 0 % | 398356046 |
116 | NC_018184 | CAT | 2 | 6 | 7442 | 7447 | 33.33 % | 33.33 % | 0 % | 33.33 % | 398356046 |
117 | NC_018184 | TGC | 2 | 6 | 7488 | 7493 | 0 % | 33.33 % | 33.33 % | 33.33 % | 398356046 |
118 | NC_018184 | GGC | 2 | 6 | 7541 | 7546 | 0 % | 0 % | 66.67 % | 33.33 % | 398356046 |
119 | NC_018184 | CGC | 2 | 6 | 7603 | 7608 | 0 % | 0 % | 33.33 % | 66.67 % | 398356046 |
120 | NC_018184 | CGG | 2 | 6 | 7615 | 7620 | 0 % | 0 % | 66.67 % | 33.33 % | 398356046 |
121 | NC_018184 | GCC | 2 | 6 | 7790 | 7795 | 0 % | 0 % | 33.33 % | 66.67 % | 398356046 |
122 | NC_018184 | TGCCTT | 2 | 12 | 7801 | 7812 | 0 % | 50 % | 16.67 % | 33.33 % | 398356046 |
123 | NC_018184 | GCT | 2 | 6 | 7863 | 7868 | 0 % | 33.33 % | 33.33 % | 33.33 % | 398356046 |
124 | NC_018184 | GAA | 2 | 6 | 7986 | 7991 | 66.67 % | 0 % | 33.33 % | 0 % | 398356046 |
125 | NC_018184 | GAC | 2 | 6 | 8075 | 8080 | 33.33 % | 0 % | 33.33 % | 33.33 % | 398356046 |
126 | NC_018184 | TGGA | 2 | 8 | 8081 | 8088 | 25 % | 25 % | 50 % | 0 % | 398356046 |
127 | NC_018184 | ACC | 2 | 6 | 8130 | 8135 | 33.33 % | 0 % | 0 % | 66.67 % | 398356046 |
128 | NC_018184 | GC | 3 | 6 | 8143 | 8148 | 0 % | 0 % | 50 % | 50 % | 398356046 |
129 | NC_018184 | GAA | 2 | 6 | 8217 | 8222 | 66.67 % | 0 % | 33.33 % | 0 % | 398356046 |
130 | NC_018184 | CAC | 2 | 6 | 8237 | 8242 | 33.33 % | 0 % | 0 % | 66.67 % | 398356046 |
131 | NC_018184 | CGTC | 2 | 8 | 8302 | 8309 | 0 % | 25 % | 25 % | 50 % | 398356046 |
132 | NC_018184 | CTG | 2 | 6 | 8352 | 8357 | 0 % | 33.33 % | 33.33 % | 33.33 % | 398356046 |
133 | NC_018184 | TCG | 2 | 6 | 8458 | 8463 | 0 % | 33.33 % | 33.33 % | 33.33 % | 398356046 |
134 | NC_018184 | CTT | 2 | 6 | 8507 | 8512 | 0 % | 66.67 % | 0 % | 33.33 % | 398356046 |
135 | NC_018184 | CAC | 2 | 6 | 8597 | 8602 | 33.33 % | 0 % | 0 % | 66.67 % | 398356047 |
136 | NC_018184 | ATA | 2 | 6 | 8710 | 8715 | 66.67 % | 33.33 % | 0 % | 0 % | 398356047 |
137 | NC_018184 | TCT | 2 | 6 | 8719 | 8724 | 0 % | 66.67 % | 0 % | 33.33 % | 398356047 |
138 | NC_018184 | CAA | 2 | 6 | 8732 | 8737 | 66.67 % | 0 % | 0 % | 33.33 % | 398356047 |
139 | NC_018184 | AGC | 2 | 6 | 8789 | 8794 | 33.33 % | 0 % | 33.33 % | 33.33 % | 398356047 |
140 | NC_018184 | ATGT | 2 | 8 | 8814 | 8821 | 25 % | 50 % | 25 % | 0 % | 398356047 |
141 | NC_018184 | TGC | 2 | 6 | 8837 | 8842 | 0 % | 33.33 % | 33.33 % | 33.33 % | 398356047 |
142 | NC_018184 | TCCC | 2 | 8 | 8853 | 8860 | 0 % | 25 % | 0 % | 75 % | 398356047 |
143 | NC_018184 | AAAC | 2 | 8 | 8894 | 8901 | 75 % | 0 % | 0 % | 25 % | 398356047 |
144 | NC_018184 | T | 6 | 6 | 8952 | 8957 | 0 % | 100 % | 0 % | 0 % | 398356047 |
145 | NC_018184 | GGC | 3 | 9 | 8984 | 8992 | 0 % | 0 % | 66.67 % | 33.33 % | 398356047 |
146 | NC_018184 | GCA | 2 | 6 | 8993 | 8998 | 33.33 % | 0 % | 33.33 % | 33.33 % | 398356047 |
147 | NC_018184 | AAG | 2 | 6 | 9028 | 9033 | 66.67 % | 0 % | 33.33 % | 0 % | 398356047 |
148 | NC_018184 | ACG | 2 | 6 | 9037 | 9042 | 33.33 % | 0 % | 33.33 % | 33.33 % | 398356047 |
149 | NC_018184 | CG | 3 | 6 | 9098 | 9103 | 0 % | 0 % | 50 % | 50 % | 398356047 |
150 | NC_018184 | AT | 3 | 6 | 9161 | 9166 | 50 % | 50 % | 0 % | 0 % | 398356047 |
151 | NC_018184 | GGA | 2 | 6 | 9441 | 9446 | 33.33 % | 0 % | 66.67 % | 0 % | 398356047 |
152 | NC_018184 | GCAG | 2 | 8 | 9494 | 9501 | 25 % | 0 % | 50 % | 25 % | 398356047 |
153 | NC_018184 | TGC | 2 | 6 | 9509 | 9514 | 0 % | 33.33 % | 33.33 % | 33.33 % | 398356047 |
154 | NC_018184 | CATT | 2 | 8 | 9563 | 9570 | 25 % | 50 % | 0 % | 25 % | 398356047 |
155 | NC_018184 | CCA | 2 | 6 | 9691 | 9696 | 33.33 % | 0 % | 0 % | 66.67 % | 398356047 |
156 | NC_018184 | CGCA | 2 | 8 | 9772 | 9779 | 25 % | 0 % | 25 % | 50 % | 398356047 |
157 | NC_018184 | GC | 3 | 6 | 9783 | 9788 | 0 % | 0 % | 50 % | 50 % | 398356047 |